50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2210 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  56.06 
 
 		 257 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  46.21 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  58.1 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  47.22 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 259 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  30.48 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 294 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 		 222 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 271 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  28.74 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  43.64 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  44.44 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 284 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 211 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 211 aa  45.4  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  37.14 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  30.63 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>