66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2216 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  45.04 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  37.96 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 296 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  33.2 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  33.46 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  29.32 
 
 		 276 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  32.28 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  26.14 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2686  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 387 aa  45.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 893 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  40.91 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  24.18 
 
 		 556 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 884 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.06 
 
 		 881 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.94 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  46.94 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  46.94 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  41.82 
 
 		 215 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 245 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 938 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 228 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>