64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5198 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
301 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  90.64 
 
 
294 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  90.38 
 
 
294 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  90.38 
 
 
294 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  93.33 
 
 
270 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  93.09 
 
 
277 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  92.73 
 
 
278 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 
276 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
271 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
285 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
264 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  28.79 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  28.99 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  26.67 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  28.78 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  26.35 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  35.14 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 
222 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  25.72 
 
 
262 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  22.87 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  22.62 
 
 
259 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  20.63 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
269 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
204 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  47.17 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  22.47 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
269 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  36.62 
 
 
188 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
215 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.4 
 
 
881 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  21.6 
 
 
271 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  23.37 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  33.33 
 
 
376 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 
574 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  37.04 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 
213 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  22.74 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  22.22 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  31.11 
 
 
207 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
207 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
296 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
220 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
893 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  34.52 
 
 
202 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>