More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3565 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 376 aa  751    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  44.94 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  37.54 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  29.12 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  30.48 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  33.09 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 376 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  29.53 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  29.94 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  28.77 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  28.37 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 151 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  46.67 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  29.12 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  50.88 
 
 		 893 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 202 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 76 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1613  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 126 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0395666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 936 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3767  regulatory protein, LuxR  47.27 
 
 		 89 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 894 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 176 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 881 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 876 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 881 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 194 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.08 
 
 		 894 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 248 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 904 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 175 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 275 aa  53.9  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 910 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3366  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 227 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.857101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 248 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  32.18 
 
 		 318 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 74 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 231 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 952 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 952 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 882 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 229 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 910 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  37.18 
 
 		 833 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 		 907 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  46.15 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 213 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  28.19 
 
 		 321 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 956 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 189 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 254 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 301 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  48 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 496 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1299  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0170327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 959 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 206 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 		 226 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 510 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 510 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0664  LuxR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 929 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 508 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 506 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>