More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3769 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  50.4 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 247 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  42.17 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  34.7 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  34.75 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 263 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 280 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 303 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  27.53 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  28.41 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 267 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  27.78 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  30.92 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  25 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  25.29 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  41.25 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.09 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  25.29 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1698  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000145996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  28.34 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.26 
 
 		 545 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  32.48 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0269  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 499 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 493 aa  52.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  42.59 
 
 		 879 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 214 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  42.37 
 
 		 196 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 223 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.628591  normal  0.692285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  42.37 
 
 		 196 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>