More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4514 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  66.54 
 
 		 262 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 262 aa  348  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 265 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 275 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 269 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 272 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  43.77 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  41.6 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 266 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 266 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  41.22 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  31.66 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  39.69 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 301 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  29.5 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  34.5 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  29.92 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  28.79 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  28.3 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.09 
 
 		 1019 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 550 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.85 
 
 		 894 aa  58.9  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  50.98 
 
 		 887 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  50 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1465  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.37 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  50 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.12 
 
 		 870 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>