More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30580 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  81.41 
 
 		 269 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  48.87 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 275 aa  198  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  37.55 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  38.49 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  33.46 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  33 
 
 		 247 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  23.74 
 
 		 271 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  27.88 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  27.24 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  27.04 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  25.65 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  24.42 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  30.21 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  57.14 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.24 
 
 		 1019 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 73 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  37.97 
 
 		 916 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4653  two component LuxR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.77 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  50 
 
 		 896 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  31.85 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  35.51 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  23.85 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  40.51 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 556 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  31.21 
 
 		 895 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  48.15 
 
 		 891 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  38.82 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.3 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 879 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  40 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 550 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 508 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>