More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06519 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  72.89 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 267 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  28.96 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  27.78 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  28.52 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  24.71 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 227 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  24.07 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 266 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 301 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  23.05 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  24.53 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  25 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  50.79 
 
 		 879 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  20.91 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 522 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2681  LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 74 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 491 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5556  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 255 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 497 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  19.7 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.54 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2115  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  28.96 
 
 		 496 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 74 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 1089 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  53.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0670  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 890 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  41.89 
 
 		 896 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 526 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 526 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 361 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  46 
 
 		 526 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  46.27 
 
 		 217 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.44 
 
 		 515 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>