More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0612 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  517  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 275 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  28.79 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  29.69 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 262 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  35.5 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  33.47 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  28.51 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  29.44 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  31.95 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  31.23 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  30.92 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 303 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  30.4 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 301 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  32.64 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 956 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.72 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 556 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2816  transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.00338242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00480  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.62 
 
 		 606 aa  58.9  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00118843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.88 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  40 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0108  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  49.09 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1008  transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  0.0679507 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  50 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1928  two component LuxR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  50 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>