More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0971 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 313 aa  636    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  37.27 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  24.84 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  36.17 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 970 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2816  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 471 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.00338242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  40.26 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  54.17 
 
 		 896 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  30.99 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  31.07 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.75 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1389  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.544965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4502  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  31.07 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  31.07 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  31.07 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  32.85 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  31.07 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  31.07 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.08 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  54 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3022  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.68 
 
 		 485 aa  59.3  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  29.57 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  40.57 
 
 		 1336 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.93 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.63 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0578  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.28 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.71 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5308  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.418046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.71 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  45.31 
 
 		 891 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  48.44 
 
 		 905 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  32.98 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  51.79 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 876 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 1084 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  43.94 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.25 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 894 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.53 
 
 		 911 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.62 
 
 		 889 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  46.94 
 
 		 896 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  37.97 
 
 		 213 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  42.86 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 229 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 905 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0496  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.484054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0476  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.123705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 905 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.33 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  46.67 
 
 		 905 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2696  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 535 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  40 
 
 		 893 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0506  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 519 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>