179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0389 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  36.6 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  28.29 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  27.13 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  30.69 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 262 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 261 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  26.46 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  27.6 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  27.17 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  26.78 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  26.54 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  26.62 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  26.6 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 243 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 242 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3221  transcriptional regulator, LuxR family  25.57 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0724  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.836709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 204 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  24.87 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 359 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 264 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.66 
 
 		 925 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  40.82 
 
 		 446 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 216 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03511  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  41.82 
 
 		 103 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0867403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  35.29 
 
 		 508 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 74 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 215 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  42.31 
 
 		 215 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  42.31 
 
 		 215 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 522 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2039  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 917 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  40.62 
 
 		 921 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 215 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 917 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 917 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 898 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 917 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>