More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03511 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03511  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  100 
 
 		 103 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0867403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 554 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3768  LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  53.7 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  53.7 
 
 		 215 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 938 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  53.7 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 1089 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 903 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  46.77 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 953 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  50.94 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  50.94 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  50.94 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  50.94 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 998 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  40.26 
 
 		 904 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 956 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3839  regulatory protein, LuxR  44.26 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  50 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 220 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 270 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.104641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  40.98 
 
 		 919 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 213 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  51.85 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 910 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  47.06 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3379  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 542 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3441  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 542 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0174834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3390  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 542 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  36.36 
 
 		 917 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 919 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 535 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.29 
 
 		 913 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  44.44 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  49.02 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  48.28 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  48.28 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2536  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  47.62 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 918 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  46.3 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>