230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0576 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 367 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  22.89 
 
 		 405 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  23.82 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  22.56 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 385 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  26.83 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.08 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  24.38 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  23.84 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  23.97 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  24.05 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  23.39 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  23.3 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  20.11 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  26.5 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  28.43 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  21.54 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  25.95 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  20.82 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  19.95 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  19.95 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  19.95 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 363 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  23.54 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  27.11 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 191 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 416 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 266 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 214 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.140358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 262 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0722  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.511528  normal  0.608348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 904 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  40.68 
 
 		 388 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  39.02 
 
 		 568 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 394 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3373  putative transcription regulator protein  22.4 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 932 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 213 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 282 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  30.86 
 
 		 508 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0724  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.836709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 879 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  20.48 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 894 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  20.48 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  34.25 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 214 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 262 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5542  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.448293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.13 
 
 		 546 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 		 921 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 266 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2775  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 481 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.257993  normal  0.934511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>