More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1037 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 363 aa  698    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  43.23 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  39.31 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  28.66 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  38.55 
 
 		 295 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  29.89 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  33.84 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  33.13 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  31.59 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 240 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  43.18 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0664  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  0.296375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 509 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  50 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 556 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.72 
 
 		 545 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 266 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 268 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 266 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 229 aa  53.5  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2693  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 80 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 175 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 178 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 178 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0363  PAS sensor protein  50 
 
 		 278 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  51.92 
 
 		 176 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 280 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 416 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0393  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 266 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4460  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.478893 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 188 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5649  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.090782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3634  transcriptional regulator, LuxR family  53.06 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.567744  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 272 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 910 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.3 
 
 		 472 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0269  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 499 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2762  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.64 
 
 		 520 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 963 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3378  LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 249 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.394495  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2504  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00866313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.77 
 
 		 862 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 250 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 203 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7175  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 218 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 227 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 213 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 208 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 258 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 279 aa  49.7  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1057  transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 486 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 492 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>