More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3498 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 73 aa  150  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 214 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.12 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 522 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  48.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  48.33 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  48.33 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  46.15 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.43 
 
 		 512 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 556 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 882 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  49.09 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 246 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 251 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 224 aa  53.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 251 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  43.33 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 228 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 266 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 257 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 257 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 272 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 243 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 223 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 219 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 262 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 223 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 257 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 266 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 262 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 266 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 493 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 257 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.64 
 
 		 546 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5542  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 212 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.448293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2108  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 516 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00926757  normal  0.183235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0436  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 501 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.09 
 
 		 229 aa  52  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 550 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.83 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  52.94 
 
 		 262 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.1 
 
 		 880 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 261 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 254 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 879 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.07 
 
 		 515 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.937657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2655  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 470 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.149331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4652  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 208 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 267 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 266 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  41.82 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 		 1019 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.86 
 
 		 472 aa  51.6  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2532  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 500 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 232 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 488 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 230 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 228 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 		 268 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 292 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  50 
 
 		 274 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 259 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>