49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2602 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  48.46 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 264 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  44.22 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  28.78 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 301 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  27.89 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  27.67 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 210 aa  48.9  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  38.18 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 208 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 211 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  27.13 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  37.93 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.89 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  33.73 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 233 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>