56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5172 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  97.83 
 
 		 277 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  92.73 
 
 		 301 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  92 
 
 		 294 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  89.45 
 
 		 294 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  89.45 
 
 		 294 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  89.71 
 
 		 270 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  27.27 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  29.63 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  26.87 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  29.62 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  30.6 
 
 		 284 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  35.14 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  31.86 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 290 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  26.9 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 269 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 856 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  31.76 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2335  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.938318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 893 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 356 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 221 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  34.41 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  34.41 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.41 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 296 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>