45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2578 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  86.49 
 
 		 222 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  40.27 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  39.68 
 
 		 257 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  27.67 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  27.04 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  44.33 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 276 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  30.43 
 
 		 312 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 280 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 259 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  43.64 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 280 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  35.62 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 295 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  44.44 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 210 aa  42  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  46.3 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>