136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1019 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  30.5 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  28.52 
 
 		 276 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  38.19 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  37.86 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  40 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  26.91 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  33.9 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  43.08 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  39.06 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.92 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  48.9  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  34.75 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  23.85 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10861  nitrate/nitrite response transcriptional regulatory protein narL  40 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 570 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 570 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 250 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2342  response regulator receiver  29.47 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 515 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2658  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 215 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  39.66 
 
 		 210 aa  45.4  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 208 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 211 aa  45.4  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.16 
 
 		 881 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.18 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.94 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1567  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0815521  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  27.78 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 1030 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  38.6 
 
 		 210 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 374 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>