More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7042 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0228  LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3373  putative transcription regulator protein  27.33 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4027  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 876 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.08 
 
 		 894 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3366  LysR family transcriptional regulator  24 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.857101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.63 
 
 		 881 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 865 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.28 
 
 		 1021 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1952  regulatory protein, LuxR  46.55 
 
 		 96 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.801604  normal  0.129884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.74 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  52.83 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  46.03 
 
 		 330 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1471  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 363 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100474  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 322 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1795  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0488628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1094  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000582737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 402 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  29.84 
 
 		 213 aa  52  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1165  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0704  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000213253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1325  putative DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0852238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1334  putative DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0448  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00573595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 435 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 160 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 325 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 325 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.22 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5403  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  52.08 
 
 		 900 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 884 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 910 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  49.09 
 
 		 903 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  26.9 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 175 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3106  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  26.16 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3965  LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  46.43 
 
 		 960 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1067  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.506731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 73 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 981 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4078  hypothetical protein  44.23 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0439982  normal  0.0668702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 1030 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4137  regulatory protein LuxR  31.08 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.272227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  42.05 
 
 		 993 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>