More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3965 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3965  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 368 aa  748    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  55.77 
 
 		 210 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  55.77 
 
 		 210 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  55.77 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  55.77 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  55.77 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  55.77 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  55.77 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  55.77 
 
 		 210 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.83 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 550 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.64 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0985  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 476 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.880452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 246 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  47.62 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 237 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  48.21 
 
 		 917 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  50.98 
 
 		 839 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 243 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 210 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 243 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.9 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 242 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  47.06 
 
 		 776 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 237 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 251 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 251 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  52.83 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3818  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  35.38 
 
 		 247 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 209 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2146  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 277 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.208263  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 232 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  47.17 
 
 		 213 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3280  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 223 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 258 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 220 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.54 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05470  putative transcription regulator protein  39.29 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.86 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  50.98 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  27.43 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  28.36 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  45.1 
 
 		 792 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  40.35 
 
 		 933 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 900 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 818 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  46 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2290  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 493 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 210 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0930  LuxR family two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 240 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.545376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2289  regulatory protein LuxR  34.04 
 
 		 151 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 210 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.51 
 
 		 546 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 952 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 952 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 235 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  44.64 
 
 		 879 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 950 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  47.92 
 
 		 214 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 288 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  33 
 
 		 216 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 218 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0445  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 534 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 905 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 178 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  50 
 
 		 248 aa  47  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 224 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 208 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 209 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>