More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05470 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05470  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 356 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3373  putative transcription regulator protein  60.59 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03364  hypothetical protein  48.28 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 202 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 1030 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 221 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1600  LuxR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 227 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 224 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 228 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0228  LuxR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 238 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4345  regulatory protein LuxR  47.06 
 
 		 216 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4714  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 216 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 215 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 202 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 218 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 210 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  34.78 
 
 		 215 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  34.78 
 
 		 215 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1997  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  30.43 
 
 		 197 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333764  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  34.78 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.21 
 
 		 230 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  42.37 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 161 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0302  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3965  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 212 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  34.78 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  49.02 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  34.78 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 919 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  40.58 
 
 		 878 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4862  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.23 
 
 		 211 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  32.05 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 508 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  50 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  50 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  50 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  50 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  42.59 
 
 		 917 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  50 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  42.86 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  50 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 356 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  44.62 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  43.55 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.04 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  50 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  38.04 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  44 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  43.55 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 233 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 230 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.11 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 224 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 214 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 215 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 211 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0091  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 954 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>