More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2913 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 356 aa  708    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  44.94 
 
 		 376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  38.06 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  35.04 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  32.86 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  29.36 
 
 		 356 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  31.64 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 151 aa  96.3  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 324 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  43.48 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  26.72 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 894 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 501 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 230 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 76 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 245 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 550 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 506 aa  52.8  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 258 aa  52.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 228 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 556 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 221 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1613  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0395666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3767  regulatory protein, LuxR  46.3 
 
 		 89 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  48.21 
 
 		 217 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 175 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.55 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 176 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 219 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 916 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  43.55 
 
 		 574 aa  51.2  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 189 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 194 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1619  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 163 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 910 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 213 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 163 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1592  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 162 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 995 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 471 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 454 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 214 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  38.24 
 
 		 219 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 881 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  43.55 
 
 		 567 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 881 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 876 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 508 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  37.5 
 
 		 221 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 223 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 221 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 221 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0440  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 526 aa  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 307 aa  49.7  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.83 
 
 		 881 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 537 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 492 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 		 207 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  47.17 
 
 		 893 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 872 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.86 
 
 		 469 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 214 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 		 498 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2358  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3149  response regulator receiver protein  50 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 202 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24980  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.29 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10150  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.66 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.906615  hitchhiker  0.00359447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 680 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06810  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.35 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4816  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.890736  normal  0.794324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  47.92 
 
 		 209 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.31 
 
 		 846 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>