More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2348 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.91 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.53 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.04 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2391  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0696687  hitchhiker  0.00128542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  31.51 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  31.53 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.6 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 224 aa  91.7  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  31.31 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 234 aa  91.3  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  29.82 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.28 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.28 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  31.7 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.41 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  29.36 
 
 		 215 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  31.07 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  30.66 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  30.66 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  30.66 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  29.82 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  30.66 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  30.66 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  30.66 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  30.66 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  31.05 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.42 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.6 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  31.16 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.56 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  28.28 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.11 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 264 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.33 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>