More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03364 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03364  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  35.85 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  29.89 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  34.86 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  27.33 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0653  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.203226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  29.56 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  30.07 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  36.08 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_003296  RS05470  putative transcription regulator protein  48.28 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1867  two component LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00198288  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  30.81 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  30.39 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.998369  normal  0.706802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.47 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.17 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.57 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1356  regulatory protein, LuxR  29.51 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  29.55 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  33.03 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.6 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3373  putative transcription regulator protein  41.82 
 
 		 336 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.7 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0393  transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 486 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0363  PAS sensor protein  31.43 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3306  LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2537  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.38 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.3 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1422  DNA-binding response regulator VraR  45 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.871667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3589  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.993543  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8454  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  hitchhiker  0.00000372445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.18 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  30.58 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.78 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  45 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5980  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  29.41 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0166  transcriptional regulator, LuxR family protein  26.72 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00243136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.58 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4648  two component LuxR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2674  two component LuxR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  26.52 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 491 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  30 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.24 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  31.71 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>