More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1345 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  95.69 
 
 		 325 aa  614  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 381 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1951  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 381 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6151  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1928  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 381 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1472  LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.659307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2488  LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1965  LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 465 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3340  LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0323949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1239  LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2331  LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 381 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506748  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1344  LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459414  normal  0.0284977 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2372  LuxR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1549  LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.730444  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  27.78 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1577  LuxR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 340 aa  99.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  35.59 
 
 		 824 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.21 
 
 		 880 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  37.88 
 
 		 888 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 910 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00480  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.02 
 
 		 606 aa  54.3  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00118843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 492 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 196 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  48 
 
 		 960 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 176 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.47 
 
 		 536 aa  53.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 208 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  29.86 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.1 
 
 		 913 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 175 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 178 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 160 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 178 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 496 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 496 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.17 
 
 		 914 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 947 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 216 aa  52.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 550 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 799 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  53.06 
 
 		 496 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 510 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  37.31 
 
 		 955 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 510 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 119 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 510 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 491 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  42.42 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 394 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 505 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0210  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 956 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  40.68 
 
 		 500 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0341  transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 478 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.953627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0730  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 209 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2932  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 492 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 981 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.36 
 
 		 925 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 940 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 217 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.07 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 196 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2762  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  42.86 
 
 		 520 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 196 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 556 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0461  transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 542 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3603  transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4850  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.0399542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 210 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 210 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 197 aa  50.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>