More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4266 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 330 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  43 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  41.45 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 339 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1951  LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1472  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.659307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2488  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1239  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3340  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0323949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2372  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6151  LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1928  LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1965  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2331  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 435 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1549  LuxR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.730444  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1344  LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 381 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459414  normal  0.0284977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  28.08 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1577  LuxR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 340 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  30.47 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 938 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 927 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 223 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0487  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 215 aa  53.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1980  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 226 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.893627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4179  hypothetical protein  43.94 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365276 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  40 
 
 		 919 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.15 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1795  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0488628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 461 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 920 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 910 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1094  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000582737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1334  putative DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  27.11 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0448  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00573595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1165  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0704  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000213253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1325  putative DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0852238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 909 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1471  DNA-binding response regulator  43.33 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 1000 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.35 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 435 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 879 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 940 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 378 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.31 
 
 		 913 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 215 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 245 aa  49.3  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 489 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 230 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 243 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 680 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0930  LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.6214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.31 
 
 		 914 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 950 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4863  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.937693  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6014  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383358  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  46.67 
 
 		 934 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 		 474 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 198 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 995 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4715  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 522 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4346  regulatory protein LuxR  35.71 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 927 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 492 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  41.82 
 
 		 919 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  37.5 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  39.47 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  32.82 
 
 		 911 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.27 
 
 		 925 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 946 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 856 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  37.7 
 
 		 913 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  38.89 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1952  regulatory protein, LuxR  34.85 
 
 		 96 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.801604  normal  0.129884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3603  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 227 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>