More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3603 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3603  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
364 aa  726    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  29.36 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
291 aa  93.6  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
378 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  35.89 
 
 
291 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
284 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  32.92 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  27.78 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.68 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  26.91 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  30.6 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  21.77 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  32.35 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  22.48 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  27.32 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.75 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  25.54 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  27.01 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  23.03 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.52 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  21.31 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  24.59 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.85 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  27.68 
 
 
279 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  25.34 
 
 
912 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
718 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 
211 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
254 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.37 
 
 
274 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
250 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  26.36 
 
 
456 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  29 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 
229 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4449  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 
253 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 
226 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
246 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 
204 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
461 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 
299 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  29.29 
 
 
505 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
228 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.97 
 
 
226 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.42 
 
 
280 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 
236 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  29.19 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.54 
 
 
226 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
226 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 
299 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
206 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
231 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 
297 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 
210 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 
284 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 
224 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  27.85 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  27.85 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  23.92 
 
 
298 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
223 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 
198 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  25.78 
 
 
716 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  27.52 
 
 
347 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
209 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.48 
 
 
303 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
224 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  24.81 
 
 
517 aa  59.7  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 
211 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  47.54 
 
 
224 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  47.54 
 
 
224 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  26.53 
 
 
790 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>