More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4179 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4179  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365276 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  66.18 
 
 		 207 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1894  putative response regulator receiver protein  40.29 
 
 		 204 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761861  normal  0.0769356 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4133  two component LuxR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1676  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0087  two component transcriptional regulator, LuxR  39.51 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1723  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0828  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00513824  normal  0.360671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2744  two component LuxR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  35.92 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0991  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.306063  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  32.84 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3283  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.335218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0664  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.358413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3170  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  30.19 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3975  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0482097  normal  0.237128 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4131  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  34.29 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  31.28 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0522  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  40.52 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.81 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.56 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1867  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00198288  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2247  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.998494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  40.38 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  33.65 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.63 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02260  Response regulator, LuxR family (CheY, HTH domains)  29.86 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2076  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2824  transcriptional regulator, LuxR response regulator receiver  37.86 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 213 aa  98.2  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02155  putative regulator in two-component regulatory system ; LuxR family protein  34.31 
 
 		 211 aa  98.6  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0029  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.42 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0011  two component LuxR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  35.65 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0584  two component response regulator  30.99 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38930  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>