269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1916 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  92.13 
 
 		 381 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6151  LuxR family transcriptional regulator  90.55 
 
 		 381 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 381 aa  774    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1928  LuxR family transcriptional regulator  90.55 
 
 		 381 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1344  LuxR family transcriptional regulator  87.23 
 
 		 381 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459414  normal  0.0284977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1951  LuxR family transcriptional regulator  91.34 
 
 		 381 aa  704    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 435 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2488  LuxR family transcriptional regulator  78.37 
 
 		 382 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1965  LuxR family transcriptional regulator  78.09 
 
 		 465 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1472  LuxR family transcriptional regulator  78.09 
 
 		 382 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.659307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3340  LuxR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0323949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2331  LuxR family transcriptional regulator  77.2 
 
 		 381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2372  LuxR family transcriptional regulator  77.2 
 
 		 381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1239  LuxR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 		 325 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1549  LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.730444  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  31.35 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  26.56 
 
 		 321 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1577  LuxR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 340 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  44.44 
 
 		 285 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 946 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 938 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 920 aa  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 231 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  21.2 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 947 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2216  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00683516  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  30.12 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1432  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 837 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.79 
 
 		 217 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 209 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  39.34 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3768  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 231 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 231 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.87 
 
 		 472 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 		 229 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39.76 
 
 		 919 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 840 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  40.38 
 
 		 884 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 227 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1680  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128873  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 218 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2104  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 235 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 215 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 226 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 249 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 215 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 226 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  41.51 
 
 		 206 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 218 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 227 aa  47  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 218 aa  47  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6289  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 515 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 146 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0574  LuxR family DNA-binding response regulator  31.75 
 
 		 258 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 489 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3769  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 205 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158689  normal  0.601222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 263 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.04 
 
 		 1019 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1558  response regulator receiver  26.43 
 
 		 221 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33920  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 213 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.100556  normal  0.165827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 217 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 210 aa  46.6  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 356 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.1 
 
 		 226 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 268 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 228 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 229 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 916 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.71 
 
 		 214 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 357 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  31.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4689  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 1000 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4166  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.49 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>