122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0159 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 381 aa  797    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15290  putative transcriptional regulator  32.01 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0074929  hitchhiker  0.0000000000000265262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1345  putative transcriptional regulator  30.42 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  29.23 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1916  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.309306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1951  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5229  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6151  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1928  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1344  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459414  normal  0.0284977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1549  LuxR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.730444  normal  0.517994 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1965  LuxR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.701067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3340  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0323949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1239  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1472  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.659307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2372  LuxR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2488  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 382 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2331  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.506748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1577  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  23.86 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 232 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  39.66 
 
 		 913 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 910 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 909 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 940 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  36.21 
 
 		 919 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 231 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 876 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 946 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 938 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 215 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 215 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  35.38 
 
 		 1336 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 257 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4071  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4000  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.348805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4016  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4179  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  40 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.88 
 
 		 925 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 197 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0228  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  29.21 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 928 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 202 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  41.07 
 
 		 196 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2959  LuxR response regulator receiver  34.57 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  33.87 
 
 		 960 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 219 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 950 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 799 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 214 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  26.79 
 
 		 977 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1432  regulatory protein, LuxR  36.36 
 
 		 837 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  38.33 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 522 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 879 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 921 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 175 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  35.82 
 
 		 225 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 230 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 196 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 260 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5021  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 855 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00982675  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  33.33 
 
 		 914 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44 
 
 		 211 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5385  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.51 
 
 		 182 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.983573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 178 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 178 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 211 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 492 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 907 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  33.33 
 
 		 196 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2765  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 77 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>