More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1067 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1067  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 205 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.506731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2115  transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5616  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0605675  normal  0.548217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.83 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0925  LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1602  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.79 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.21 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3507  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  37.86 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  33.87 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  33.87 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  39.02 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  44 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  32.26 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  40.24 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 938 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1373  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.67 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3116  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.11 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  35.9 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.59 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.34 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  36.44 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  37.8 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.56 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  35.34 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  36.51 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  48.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  31.16 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4027  LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  49.15 
 
 		 963 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>