60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1993 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 374 aa  773    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 377 aa  544  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 375 aa  511  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  27.72 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 378 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 405 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  24.47 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  22.01 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  22.55 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  23.96 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  24.27 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  21.47 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  25.14 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  22.63 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  23.12 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  22.72 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  23.61 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  20.56 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  20.89 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  20.56 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  24.55 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  23.98 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  21.54 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.43 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  21.66 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  25.2 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  22.81 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0747  transcriptional regulator, LuxR family  28.75 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  23.57 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0711  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  23.57 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0748  transcriptional regulator, LuxR family  28.75 
 
 		 176 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  22.26 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>