71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2575 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  85.16 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 264 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  42.42 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  30 
 
 		 284 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 277 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  39.68 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 222 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 277 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  26.69 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  26.14 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  43.1 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  37.08 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  37.08 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.08 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  40.54 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.83 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  41.82 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.25 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  34 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1607  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  40.35 
 
 		 188 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 262 aa  42  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 213 aa  42  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.11 
 
 		 220 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>