57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4122 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  92.18 
 
 		 294 aa  557  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  99.63 
 
 		 270 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  90.38 
 
 		 301 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  89.82 
 
 		 277 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  89.45 
 
 		 278 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 276 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  29.17 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  29.89 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  28.62 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  29.57 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  26.98 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  35.83 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  23.9 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 276 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  22.9 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  22.76 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.48 
 
 		 881 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  29.67 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 856 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 219 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 202 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  33.93 
 
 		 188 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>