52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2601 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 284 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 222 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  28.78 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  40.27 
 
 		 226 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  30 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  28.16 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  28.79 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1325  transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 216 aa  48.9  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  42.86 
 
 		 217 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  40.74 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0287  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 92 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2406  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 92 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  29.31 
 
 		 188 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 213 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 91 aa  42.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02261  LuxR family regulatory protein  38.81 
 
 		 90 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0250136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 880 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 926 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  34.04 
 
 		 210 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>