More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0849 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  44.02 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 271 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  41.87 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  41.87 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  41.87 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  41.87 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  38.61 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  38.73 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3481  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.016753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  38.42 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  38.42 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  38.42 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  38.42 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  38.42 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  38.42 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 215 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  39.13 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  38.42 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 455 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 215 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  39.22 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 282 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  36.95 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  37.25 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  36.95 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>