213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2821 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  35.25 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  25.97 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  54.39 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  25.1 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  26.59 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  34.82 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  27.54 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2409  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 221 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 204 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5021  putative transcriptional regulator  41.79 
 
 		 855 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00982675  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  44.83 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.93 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 556 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.8 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  32.06 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 201 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 209 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  23.62 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 550 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 217 aa  45.8  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 270 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 272 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  42.37 
 
 		 188 aa  45.8  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1607  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  27.34 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  37.68 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  39.62 
 
 		 893 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 233 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  39.13 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2048  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03364  hypothetical protein  38.18 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4796  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00878953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0833  regulatory protein, LuxR  33.72 
 
 		 904 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  24.64 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>