More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0833 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0833  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 904 aa  1813    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  23.91 
 
 		 894 aa  117  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0670  regulatory protein, LuxR  24.32 
 
 		 890 aa  94.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.73 
 
 		 887 aa  87.4  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.53 
 
 		 905 aa  84.7  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  23.27 
 
 		 947 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  23.52 
 
 		 861 aa  82  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  22.69 
 
 		 879 aa  76.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  22.49 
 
 		 899 aa  75.1  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  22.88 
 
 		 901 aa  73.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.41 
 
 		 896 aa  72.4  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1432  regulatory protein, LuxR  23.27 
 
 		 837 aa  72  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.27 
 
 		 889 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.08 
 
 		 913 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.34 
 
 		 933 aa  67.8  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  22.37 
 
 		 902 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  21.81 
 
 		 902 aa  62  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  41.57 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.18 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  27.81 
 
 		 900 aa  57.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  23.48 
 
 		 921 aa  57.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  23.29 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1493  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 224 aa  57.4  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 226 aa  57.4  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 213 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 214 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 215 aa  57  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 214 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 491 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 218 aa  57  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 214 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 214 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 214 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 214 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 214 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0210  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 500 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 215 aa  56.6  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 213 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 218 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  34.69 
 
 		 217 aa  55.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  20.45 
 
 		 903 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5649  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 486 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.090782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4460  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 486 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.478893 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  20.45 
 
 		 903 aa  55.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 214 aa  55.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 215 aa  55.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 275 aa  54.7  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 514 aa  54.7  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 514 aa  55.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 209 aa  54.7  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  54.7  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 514 aa  54.7  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 		 556 aa  54.7  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  43.33 
 
 		 285 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 210 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 231 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 220 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  23.74 
 
 		 1110 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 242 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 225 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 210 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 224 aa  53.9  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 224 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.1 
 
 		 213 aa  53.5  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 219 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 231 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.47 
 
 		 930 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 237 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  23 
 
 		 914 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  22.9 
 
 		 854 aa  53.5  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 228 aa  53.5  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 510 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 242 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 227 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5114  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 230 aa  53.5  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 292 aa  53.5  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0722  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 206 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.511528  normal  0.608348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0924  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 359 aa  53.5  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  40 
 
 		 231 aa  52.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  45.9 
 
 		 496 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 343 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 510 aa  53.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2048  transcriptional regulator, LuxR family  53.19 
 
 		 280 aa  52.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 		 210 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  39.18 
 
 		 231 aa  52.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.84 
 
 		 1019 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 230 aa  52.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 227 aa  52.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>