163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10980 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  26.29 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  26.64 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 285 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 204 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 509 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  29.19 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  40.28 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.1 
 
 		 536 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  32.46 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.45 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 894 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0739  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 204 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.297506  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 207 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 224 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 222 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  40.62 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1828  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  29.67 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 189 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3794  response regulator receiver protein  33.71 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2258  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 476 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  30.11 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2305  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  29.29 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6094  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634688  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 441 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>