164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6064 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  92.78 
 
 		 277 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 271 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  37.68 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2602  regulatory protein, LuxR  32.12 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.718  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  24.81 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2607  regulatory protein, LuxR  33.83 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0221488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  27.2 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2210  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2833  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  30.14 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 268 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 550 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2578  regulatory protein, LuxR  32.52 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  49.02 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0897  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  44.64 
 
 		 188 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  27.34 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4314  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  22.93 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  39.47 
 
 		 903 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1038  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.942109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1607  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266898  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  34.83 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 536 aa  45.8  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4796  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 206 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00878953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 198 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 216 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1260  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.22 
 
 		 895 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  26.52 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.1 
 
 		 914 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2658  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3373  putative transcription regulator protein  36.92 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.46 
 
 		 881 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  45.83 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3765  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  41.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 894 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  38.33 
 
 		 934 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2586  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.646343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3106  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>