256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1260 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1260  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  524  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1892  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3221  transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1723  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1964  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2364  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461872  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  25.3 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.04 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 556 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 214 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 550 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1614  two component LuxR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0699  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 947 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  30.08 
 
 		 496 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 994 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0169  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  36.21 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  40.68 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  35.06 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 343 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 347 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1539  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 921 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 141 aa  45.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  42.59 
 
 		 921 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 222 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266898  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0210  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 500 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 509 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  42.59 
 
 		 921 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0894  putative outer membrane component of efflux system  38.89 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00401485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  43.86 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2513  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 78 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4796  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00878953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1533  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.717435  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 881 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.03 
 
 		 862 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.74 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  42.59 
 
 		 500 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 881 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 876 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 882 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.14 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 514 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.07 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  24.47 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 514 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 951 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.07 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02940  putative LuxR-family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 894 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  40.38 
 
 		 896 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  41.07 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>