180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1538 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 385 aa  798    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  29.55 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  26.05 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  29.44 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  24.77 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 215 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  23.2 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  25.84 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  23.74 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  23.95 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  49.12 
 
 		 213 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  23.96 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  25.83 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  25.97 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  21.07 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  43.55 
 
 		 159 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1509  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.198395  normal  0.0597777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 226 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.51 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.07 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  32.58 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0711  LuxR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 196 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 266 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 213 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0748  transcriptional regulator, LuxR family  35.42 
 
 		 176 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  40 
 
 		 221 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 211 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0747  transcriptional regulator, LuxR family  35.42 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 357 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 222 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  26.36 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 229 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4688  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 252 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  44.64 
 
 		 248 aa  46.6  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  48.21 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.62 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  26.29 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 224 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.46 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 224 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1260  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  25.26 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4158  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  43.86 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  41.67 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  23.85 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12791  hypothetical protein  47.92 
 
 		 233 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0492582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>