157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0614 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 362 aa  734    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 362 aa  734    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  99.17 
 
 		 362 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  29.72 
 
 		 411 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.06 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  29.82 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  26.12 
 
 		 395 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  24.05 
 
 		 405 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  31.49 
 
 		 380 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 385 aa  86.3  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  27.06 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.94 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  26.88 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  24.54 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  22.19 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  19.11 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  25.87 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  27.69 
 
 		 393 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  25.6 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  22.73 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  26.05 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  22.13 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  33.05 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  22.51 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  30.39 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  22.05 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  30.45 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  50.82 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  29.47 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 394 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  32.65 
 
 		 568 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 586 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  25.82 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2779  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 505 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.980405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.22 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  25.8 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 416 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22730  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.57 
 
 		 502 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  25.23 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 588 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 546 aa  52.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0514  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 493 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.559597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3038  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 569 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  27.48 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  35.48 
 
 		 578 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 313 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2786  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 511 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0490323 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2696  transcriptional regulator, LuxR family  32.05 
 
 		 535 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0171  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 484 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0559  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0841173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  27.02 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>