More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0748 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0748  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 176 aa  339  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.041064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0747  transcriptional regulator, LuxR family  97.73 
 
 		 176 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0711  LuxR family transcriptional regulator  97.66 
 
 		 196 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  40.62 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 954 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0091  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 211 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  36.36 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 204 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 188 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  36.54 
 
 		 224 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2115  transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 267 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  41.38 
 
 		 218 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  32.85 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0011  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0029  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  44.23 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3086  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 292 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0219  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.463895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 123 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0937  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 952 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 992 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1738  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 267 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 535 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.82 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3356  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.334369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 952 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  44 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 983 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  40.35 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.53 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 312 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 993 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 209 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 218 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.353555  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 312 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 364 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 312 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  43.4 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2921  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  31.88 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  35.59 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0448  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 279 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00573595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 1084 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1795  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 279 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0488628  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 209 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1334  putative DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 279 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1165  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 279 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742681  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 211 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>