94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3054 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 368 aa  738    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  37.22 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  30.6 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 370 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  28.23 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  28.8 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 191 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  28.8 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  27.86 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 188 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  25.33 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  28.72 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  23.27 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  32.63 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  32.34 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  30.04 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  26.88 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.81 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  27.24 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  30.6 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  55.36 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  30.25 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  28.43 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28.51 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  25.31 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28.51 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  50.88 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  24.37 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  49.12 
 
 		 275 aa  54.3  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  23.32 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 363 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  48.72 
 
 		 381 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  31.78 
 
 		 578 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  31.25 
 
 		 191 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  48.39 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 206 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  39.74 
 
 		 568 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>