94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6522 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 368 aa  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 368 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 370 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 378 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 365 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  29.52 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  36.75 
 
 		 229 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  28.12 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  27.92 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  28.53 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  26.68 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  23.4 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  50 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.95 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  47.69 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  27.18 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  32.31 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  33.04 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  26.37 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 188 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  26.56 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  30 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  47.69 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  45.9 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  49.21 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 417 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 417 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 191 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  25.84 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 187 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  32.65 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  30.08 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 227 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 385 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  27.46 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  44.44 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  30.57 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.34 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  23.86 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 237 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 151 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 208 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 374 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.5 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  37.88 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  21.86 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 207 aa  43.9  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  22.05 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>