113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5209 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  100 
 
 		 378 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  30.03 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  31.02 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  29.4 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  29.4 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  30.74 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  25.8 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.51 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  24.74 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  24.86 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  33.15 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  29.66 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  19.48 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  24.04 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  27.72 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  20.6 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 588 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  24.07 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  22.13 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  26.84 
 
 		 188 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  22.99 
 
 		 350 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 378 aa  53.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  21.85 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  29.2 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  22.85 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  26.54 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  23.62 
 
 		 280 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  26.07 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 187 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  26.61 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 232 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  25.37 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  19.76 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 208 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 191 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  26.42 
 
 		 411 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 224 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.29 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  24.69 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.89 
 
 		 209 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  27.89 
 
 		 568 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 258 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 208 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>