85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0499 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 377 aa  757    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  48.68 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  38.1 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  37.92 
 
 		 350 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  26.65 
 
 		 395 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 394 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  30.47 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  24.49 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  23.2 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 586 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  25.76 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  26.05 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  27.53 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  26.05 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  44.12 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  25 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  25.59 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 191 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  24.91 
 
 		 374 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  21.95 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  25.19 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 385 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  25.7 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  41.41 
 
 		 187 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.39 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  47.76 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  25.94 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  25.07 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  43.55 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  27.49 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 207 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 321 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 188 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 151 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  41.38 
 
 		 275 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  27.32 
 
 		 178 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  27.32 
 
 		 178 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  24.29 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  42.62 
 
 		 578 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 367 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  37.29 
 
 		 232 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  35.44 
 
 		 568 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>