91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1493 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 370 aa  745    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  40.9 
 
 		 388 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  40.62 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  32.96 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 367 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  38.27 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 391 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  28.95 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  25.68 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  26.39 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  26.39 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  29 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  52.69 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  27.37 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  28.16 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.02 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  38.96 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  24.9 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  40.2 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  26.01 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 588 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  44 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 187 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  26.43 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 191 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 363 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 586 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  41.54 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  28.15 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  34.62 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  39.39 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 378 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  22.55 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 372 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  48 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  24.27 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  34.83 
 
 		 839 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  38.24 
 
 		 578 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2822  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 211 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2324  DNA-binding response regulator  31.67 
 
 		 217 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 180 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 339 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2336  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 322 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>